مسئولیت این معاونت بر عهده‌ی مدیریت فرآیندهای بازرگانی، تجاری و قراردادی در سازمان است. هدف اصلی این معاونت، به حداکثر رساندن سودآوری شرکت از طریق افزایش فروش و کاهش هزینه‌های بازرگانی و تجاری است.

از وظایف معاونت بازرگانی می‌توان به موارد زیر اشاره کرد:

• بررسی و انتخاب تامین‌کنندگان و پیمانکاران، از جمله ارزیابی کیفیت و قیمت پیشنهادی آن‌ها و انجام مذاکرات با آن‌ها در خصوص قراردادهای تجاری و بازرگانی
• مدیریت فرآیند صدور پیش فاکتور، فاکتور و مدارک بازرگانی مربوط به واردات و صادرات کالاها
• تعیین نرخ تبادلات ارزی و کنترل موجودی ارز در شرکت
• بررسی و تنظیم قراردادهای بازرگانی با شرکت‌ها و مشتریان داخلی و خارجی
• بررسی و تنظیم قوانین و مقررات بازرگانی داخلی و خارجی برای اجرای بهتر و صحیح تر معاملات بازرگانی
• تحلیل و بررسی بازار و رقبا برای پیش بینی وضعیت بازار و افزایش فروش و سودآوری شرکت
• ارائه مشاوره‌های بازرگانی به سایر بخش‌های شرکت به منظور بهبود وضعیت بازرگانی شرکت